1.時間短，速度快。相比傳統的熱殺菌，需要通過熱傳導、對流或輻射將熱量從食物表面傳遞到內部，達到滅菌溫度通常需要很長時間。微波殺菌設備則是微波能量與食物、等微生物之間的直接相互作用，以及熱效應和非熱效應的共同作用，從而完成快速加熱殺菌的目的，從而大大縮短了處理時間。

2.保持了營養成分和傳統風味。通過的加熱和非加熱作用進行殺菌，可以在更低的溫度和更短的時間內獲得所需的殺菌效果。

3.它是直接作用于材料，因此沒有額外的熱損失。對比傳統的熱殺菌，它可以節電30%-50%。

4.控制微波滅菌處理，傳輸速度可從零開始連續調節，操作方便。

5.能夠提高工作條件，節省占地面積。