微波殺菌設備是工業微波設備中的一種，但是大多數人不知道它是干什么用的，也不知道它的工作原理是怎樣的。微波殺菌設備是利用了電磁場的熱效應和生物效應的共同作用的結果。微波對細菌的熱效應使蛋白質發生變化，使細菌失去了營養，繁殖和生存的條件而被消滅。微波對細菌的生物效應是微波電場改變細胞膜斷面電位的分布，影響細胞膜周圍電子以及離子濃度，從而改變了細胞膜的通透性能，細菌因此就會營養不良，不能正常地代謝，細胞結構功能就會紊亂，生長發育受到抑制而死掉。